Em Pokemon Conquest, os jogadores deverão tomar a posição de um jovem Warlord que é ligado a pokemon. Juntos eles deverão recrutar guerreiros alianos para deixar ainda mais forte seu crescente reino. Dentro de sua jornada, os jogadores enfrentarão uma variedade de Pókemon, junto com Guerreiros e Guerreiras inspirados na era feudal japonesa. O jogo contém quase 200 Pokémon, incluindo muitos dos mais recentes de Black e White, que venderam 4 milhões de cópias combinadas apenas nos EUA.
Enquanto os campos de batalha se desdobram em Pokemón Contest, os jogadores deverão escolher o tipo correto de Pokémon para infligir o dano máximo em seus oponentes, em batalhas baseadas em turno, os jogadores deverão escolher diferentes táticas para intensas 6x6, e condições mudando a cada turno, deixando os jogadores na expectativa do que vai acontecer em seguida.